本書《巨靈動員令》是「月光三部曲」的第二部曲。

首部曲《淡水女巫的魔幻地圖》是一部「穿越淡水四百年歷史」的奇幻冒險小說，描述少年月之華為了尋找失蹤的姑姑月影，意外發現家中祖傳的鹿皮地圖是個神奇的魔法門。經由時空隧道，之華回到過去的淡水，找到了姑姑，卻也受到一個西班牙幽靈法師的脅迫。這名幽靈法師企圖重新殖民艾爾摩沙（臺灣）。能用來抵抗鬼魅入侵的，只有被喚醒的人性。

此書凡涉及歷史之處，皆經考證。故事的經營在於追索一個主題：以西班牙殖民北臺灣史和清法戰爭作為兩個主要的背景，並呈現巴賽族（Basay）的原住民文化（尤其是女巫文化），經由淡水一地對外關係的回顧，反思人與人、種族與種族、國家與國家之間的相處之道。故事在最後藉著主要人物的行動，展現了「將心比心」的體悟的力量。

《巨靈動員令》延續《淡水女巫的魔幻地圖》的奇幻冒險風格，繼續探索臺灣的歷史，而鎖定的對象是日本的對臺殖民統治，以及在同一時期具有密切關係的日本對華侵略戰爭。

月影姑侄這次往返淡水的過去與現在，面臨日本國家神道和日本軍國主義的威脅。他們對日本皇室巨靈的抵抗行動成功與否，關係到眾多的生靈。為了主題的突顯和情節的鋪陳，本書在故事中設置了一個「東京―南京―臺北」的三角關係。藉由這個三角關係，故事觸及日本國家神道、長崎原爆、南京大屠殺、皇民化教育、日本三一一大地震、臺灣募集巨資援救日本災難等許多重大事件，從中進行歷史反思。

故事的結尾撫慰了受創的心靈，並藉由一些具有良知的日本人的懺悔，提醒日本應正視過去所犯的歷史錯誤。