馬水龍作品出版
財團法人邱再興文教基金會
1.《弦樂四重奏》1983年
《String Quartet》(1983)
這首連樂章體式的四重奏，可分為：生氣蓬勃的快板、吟詩般的慢板、如歌的行板及生動活潑的終曲這四部分。在曲子進行上，樂章與樂章之間是相連不斷的，一章的結束是下一章的開始，在綿延與連繼之間，樂念流暢地發展下去。
第一樂章是以強而有力的撥奏來揭開序幕，並且以中國傳統的鑼鼓節奏來進行，之後主題由大提琴導入。第二樂章是整曲最大的對比與張力點，是以「吟詩」的樂念來發展。第三樂章整合了第一、第二樂章之後，發展到終曲。整曲在內容上，第一、第三與第四樂章的關係是非常密切，其間不同之處只是由於經由各種手法的變化所致。
音樂的內容就是一種風格，作曲者在形式的侷限下，運用新的理念及手法，呈現了四重奏的另一種境界。
※本曲係文建會委託創作，於1983年完成之作品，1987年樂譜初版，並於2016年再版。
1985年1月4日首演於台大學生活動中心大禮堂，由台大愛樂社主辦之「馬水龍室內樂之夜」。演奏家為第一小提琴江維中、第二小提琴洪千貴、中提琴巫明俐、大提琴孫琬玲。
2. 《水墨畫之冥想》（九支大提琴室內樂曲） 1994年
《Meditation on Ink Painting》for Nine Cellos (1994)
作曲者自幼喜愛繪畫與音樂。爾後，雖然選擇了音樂為終身志業，但對繪畫的興趣與狂熱，始終有增無減。在已完成的音樂作品中，幾首均與繪畫有密切的關係。作曲者認為，所有的藝術創作，雖然因其使用的素材不同或表現的技法相異，但最後所要呈現的藝術本質，應是殊途同歸，音樂與繪畫更是不例外。
本曲創作的動機，來自於傳統水墨畫中的「虛實相生」觀念。古人笪重光「畫筌」云：實處之妙，皆因虛處而生，也就是無虛不易顯實，無空不能存虛。無疏不能成密，無密不能見疏，是以虛實相生，疏密相用。作曲者試圖以此繪畫手法，呈現在此首樂曲結構中，如時間與空間的對比，織度與密度的互換，實體與空靈的轉變等，以求音畫之意境。
※本曲由文建會委託創作，首演於1995年11月25日於國家演奏廳，由財團法人邱再興文教基金會主辦之「春秋樂集95秋·室內樂之夜」。由涂惠民擔任指揮，大提琴演奏家為孫琬玲、黃智瑛、鄭佩玲、曾史妃、洪婉容、黃韻宇、劉姝嫥、蘇千芳、王佩瑜。
3. 《祝福》給鋼琴、小提琴與大提琴三重奏(2013)
《Blessing》Trio for Piano, Violin and Cello (2013)
此曲原作為給豎琴、小提琴與大提琴三重奏，創作於1998年，是作曲者為長子的婚禮而作，名為《祝福》，後於2013年改編給鋼琴、小提琴與大提琴的版本，並以此出版。樂曲由一段優美的行板開始，描寫父母對子女殷切的關懷與叮嚀，慢慢再轉為活潑的小快板，象徵陽光般的年輕人充滿喜悅的結合。而後，音樂再回到行板，祝福這對新人永遠幸福美滿。
※本曲於1998年首演於台北圓山飯店，首演編制及演奏家為豎琴黃嘉慧、小提琴留慈芳與大提琴林榆婕。其後也採用不同的配器演出，例如：豎琴、長笛與低音管；鋼琴、小提琴與大提琴，都各具情調。
4.《木管五重奏》2002年(賴德和撰寫)
《Woodwind Quintet》(2002)
本曲是2002年馬水龍教授特地為次子婚禮現場演出所譜寫。這一首活潑愉悅的曲子概分為五段：第一主題五聲音階徵調式，主旋律出現在長笛聲部。這個主題轉到五度上的調，先後輪流出現在雙簧管、豎笛及巴松管。由法國號吹奏卑南族的「婚禮之歌」是形成對比的慢板第二主題。接著活潑愉悅的第一主題再現，調性轉到降D音徵調式，出現在雙簧管聲部，接著在豎笛聲部加以變奏。第三主題速度加快，出現在巴松聲部的主旋律是泰雅族的「口簧對歌」。這是一首男女青年一面吹奏單簧口琴，一面演唱情歌的舞曲。這個熱情的舞曲先後在雙簧管和豎笛聲部加以變奏之後結束第三主題。最後第一主題再現，堆疊出高潮式的尾聲。值得重視的是，父親送給兒子的結婚禮物，還費盡巧思精挑细選了兩首原住民跟愛情結婚有關的音樂，揮灑出一闕別緻的婚禮迴旋曲。
※本曲於2002年首演於台北亞都飯店，演奏家為長笛黃馥茗、雙簧管洪千智、單簧管黃貞華、低音管郭怡芬、法國號黃義敦。
5. 《懷念》，雙簧管與鋼琴二重奏2002年
《In Memoriam for Oboe and Piano》(2002)
全曲不分樂章，一氣呵成有如一敘事曲。
起始動機中的下行小二度為整曲發展之重要樂素；如嘆息般地不斷出現，樂句間綿密的堆砌如思念之情縈迴不去，至深切處無限地懷念。
※本曲於2002年11月世界首演於鳳甲美術館，是為紀念同窗摯友邱再興先生之夫人–許秀桂女士而作。由謝宛臻小姐擔任雙簧管演出，邱君強先生擔任鋼琴伴奏。
6. 《白鷺鷥的願望》，鋼琴與弦樂四重奏2002年
《The Egret's Wishes for Piano and String Quartet》(2002)
本曲應白鷺鷥文教基金會之委託，特別以台灣童謠＜白鷺鷥＞的旋律為創作之主要素；全曲略分為四段，動機之發展亦為單純，但每一段均在變化中；如多種的理念在異中求同之過程中得到純化，象徵白鷺鷥乘著希望之翼翻山越嶺，飛向安和幸福的家園。
※本曲首演於2002年8月25日，於國家音樂廳舉辦的「第二屆加台夏季音樂節」。演奏家為鋼琴奈良希愛，第一小提琴Edmond Agopian ，第二小提琴吳孟平，中提琴楊瑞瑟，大提琴林浥雯。
7. 《中國民謠合唱曲集》
《Chinese Folk Songs for Chorus》
菜子花兒黃
想起了
玩燈
小河淌水
阿拉木汗（混聲合唱）
阿拉木汗（同聲合唱）
8. 《臺灣歌謠合唱曲集》
《Taiwanese Songs for Chorus》
西北雨直直落
六月田水
黑面祖師公
卜卦調
農村曲
安童哥買菜（混聲合唱）
安童哥買菜（同聲合唱）
馬水龍《木管五重奏》（邱再興文教基金會出版）封面
馬水龍《水墨畫之冥想》（邱再興文教基金會出版）封面
馬水龍《白鷺鷥的願望》（邱再興文教基金會出版）封面
馬水龍《弦樂四重奏》（邱再興文教基金會出版）封面
馬水龍《懷念》（邱再興文教基金會出版）封面
馬水龍《祝福》（邱再興文教基金會出版）封面